Description du module de processus d'observation ou de fonction de contraste
Il s'agit ici de définir une fonction qui associe une valeur réelle à une simulation donnée. Cette fonction dépend donc des valeurs prises par les paramètres du modèle. Cette fonction peut décrire un processus d'observation ou être une fonction que l'on cherchera à optimiser.
Fonctions prédéfinies
L'environnement MSE propose une bibliothèque de fonctions.
Processus de détectabilité
C'est un processus de présence/absence tenant compte d'un taux de détection prédéfini. Pdetect est la probabilité de présence/absence sachant la densité de population.
Processus de détectabilité paramétré
C'est le même processus que précédemment mais le taux de détection est un paramètre.
Intégrale des erreurs quadratiques
Il s'agit ici de l'intégrale de la différence quadratique entre la simulation et les données pour quelques dates.
Le tutoriel 'grippe' décrit comment définir cette fonction de coût.
Somme des erreurs quadratiques
Il s'agit ici de la différence quadratique entre la simulation et les données pour quelques points de l'espace et du temps.
Le tutoriel 'donnée initiale paramétrée' décrit comment définir cette fonction de coût.
Ajout de fonction
Il est possible de définir toute autre fonction. Cela se fait en modifiant le fichier 'functMesure.edp' dans le répertoire du simulateur.
A titre d'exemple, le tutoriel 'analyse de sensibilité' utilise le fichier 'functMesure.edp' qui implémente le calcul d'intégrale quadratique de la densité de population suivant :